Στις Κυκλάδες το ΤΑΙΠΕΔ βγάζει στο σφυρί 4 περιοχές υγρότοπων σε Νάξο, Μήλο και Ανδρο που βρίσκονται εντός ορίων περιοχών Natura 2000 (Ειδικές Ζώνες Διατήρησης, από τις οποίες οι 3 και εντός Ζωνών Ειδικής Προστασίας - περιοχών σημαντικών για τα πουλιά), έναν υγρότοπο στη Νάξο που έχει χαρακτηρισθεί καταφύγιο άγριας ζωής, και 3 περιοχές υγρότοπων σε Πάρο - Αντίπαρο που έχουν χαρακτηρισθεί προστατευόμενοι ως μικροί νησιωτικοί υγρότοποι.

Από τις πιο γνωστές παραλίες που παραχωρούνται είναι:

Γαλησσάς στη Σύρο

Αγεσαρνή Λίμνη Αλυκής στη Νάξο

Αγιος Προκόπιος στη Νάξο

Αλυκή Πάρου

Ατένι στην Ανδρο

Λιβάδι στην Ηρακλειά

Βέβαια οι αντιδράσεις από κατοίκους και φορείς είναι πολλές. Μάλιστα όπως γράφει το ΕΘΝΟΣ στην περίπτωση της Ηρακλειάς που αναμένεται να παραχωρηθεί έκταση 7.239 τ.μ. στο Λιβάδι, οι κάτοικοι μιλούν για θέμα ελεύθερης πρόσβασης στη μία από τις δύο προσβάσιμες παραλίες του νησιού.